Greenpeace je proti akémukoľvek uvoľňovaniu geneticky manipulovaných organizmov (GMO) do životného prostredia. V súčasnosti sú GMO uvoľňované do životného prostredia bez dostatočného vedeckého pochopenia ich dopadov ako na životné prostredia tak aj ľudské zdravie.
Toto genetické "znečistenie" predstavuje veľkú hrozbu, pretože GMO sa po uvoľnení do životného prostredia nedajú vrátiť naspäť. Na tento problém poukazujú aj medzinárodné dohody ako napríklad Protokol o biologickej bezpečnosti.
Kvôli firemným záujmom je verejnosti často odmietané právo vedieť o GM potravinách a právo odmietnuť ich. Greenpeace preto presadzuje okamžité zavedenie dočasných opatrení ako sú:
Greenpeace je tiež proti všetkým patentom na rastliny, zvieratá a ľudí, ako aj ich gény. Život nie je tovar a preto nesmie byť predmetom súkromného vlastníctva.
Na Slovensku sa zatiaľ podarilo dosiahnuť záväzok niektorých z najväčších supermarketov a výrobcov potravín nepredávať a nevyrábať GM potraviny.